Na zakładce [JPK] istnieje możliwość przypisania znaczników JPK: S_12_1, S_12_2 oraz S_12_3.

Dla ZOiS1, ZOiS2, ZOiS3, ZOiS4, ZOiS5, ZOiS6, ZOiS7 znaczniki S_12_1 i S_12_2 są wybierane z listy rozwijalnej. Dla ZOiS8 znaczniki S_12_1 i S_12_2 mogą być wpisane ręcznie.

Na koncie księgowym najniższego poziomu powinien być uzupełniony przynajmniej znacznik S_12_1. Podczas zapisywania zmian na formularzu konta księgowego program sprawdza czy znacznik S_12_1 jest uzupełniony. Jeżeli pole nie będzie uzupełnione, to pojawia się komunikat Nie uzupełniono znacznika konta S_12_1 wymaganego dla plików JPK_KR_PD. Czy chcesz go dopisać?. Do wyboru jest opcja Tak lub Nie. Po wyborze opcji Tak program przekierowuje na zakładkę [JPK] i kursor ustawia się w polu ze znacznikiem S_12_1. Po wskazaniu opcji Nie formularz zostanie zapisany bez uzupełnionego znacznika S_12_1.

W przypadku kopiowania planu kont na kolejny okres obrachunkowy oraz aktualizacji planu kont z poprzednim okresem obrachunkowym znaczniki JPK przypisane do kont księgowych są kopiowane na konta księgowe w nowym okresie obrachunkowym. Kopiowanie planu kont między różnymi bazami wraz ze znacznikami JPK jest możliwe jeżeli Typ ZOiS w obu bazach jest taki sam. Jeżeli Typ ZOiS jest różny w obu bazach, to znaczniki JPK nie są kopiowane.