Na zakładce „Konfiguracja” dla administratora dostępna jest opcja „Włącz komunikat przy zapisie definicji typu obiegu”.
Jeżeli użytkownik wybierze w parametrze wartość „Tak”, to podczas próby opuszczenia definicji typu obiegu, bez uprzedniego zapisania zmian, zostanie wyświetlony komunikat:
Jeżeli wartość parametru będzie ustawiona na „Nie” komunikat nie będzie wyświetlany, co może skutkować utratą wprowadzonych zmian.
W wersji 2023.0.0 w zakładce Konfiguracja dodano parametr Po uruchomieniu systemu wyświetlaj, który określa, które okno powinno zostać wyświetlone po starcie Comarch DMS. Użytkownik może wybrać jedną z dwóch opcji:
- Listę dokumentów – wówczas po uruchomieniu aplikacji desktop Comarch DMS wyświetlana jest lista dokumentów, tak jak do tej pory
- Stronę startową – wtedy po uruchomieniu aplikacji desktop Comarch DMS wyświetlona zostaje strona startowa; jest to wartość domyślna parametru (zob. Strona startowa)
Parametr Po uruchomieniu systemu wyświetlaj jest widoczny dla wszystkich użytkowników.
Jeżeli Comarch DMS współpracuje z Comarch ERP Altum, wówczas na zakładce „Konfiguracja” dostępny jest parametr Uruchom Comarch ERP Altum w tle – parametr odpowiadający za to czy Comarch ERP Altum będzie uruchamiany w tle podczas włączania Comarch DMS, czy podczas pierwszego wywołania okien Altum (Lista artykułów, kontrahentów, dokumentów) z poziomu Comarch DMS:
- TAK – oznacza, że system Comarch ERP Altum zostanie uruchomiony w tle podczas uruchamiania Comarch DMS;
- NIE – oznacza, że system Comarch ERP Altum zostanie uruchomiony w tle podczas pierwszego wywołania okien Altum (Lista artykułów, kontrahentów, dokumentów) z poziomu Comarch DMS.
W wersji 2024.3.0 w ramach zakładki 
[Panel użytkownika] dodano sekcję „Logowanie dwuetapowe”. W ramach tej sekcji operator może dobrowolnie włączyć lub wyłączyć logowanie dwuetapowe do Comarch DMS.
Aby włączyć logowanie dwuetapowe należy w ramach sekcji „Logowanie dwuetapowe” kliknąć w link 
[Włącz logowanie dwuetapowe]. Wówczas zostaje otwarte okno „Włącz logowanie dwuetapowe”.
Następnie operator musi kolejno wykonać następujące czynności:
1. Pobrać aplikację Google Authenticator na urządzeniu mobilnym 2. Otworzyć aplikację Google Authenticator 3. W aplikacji Google Authenticator kliknąć w przycisk „Dodaj kod” 4. Wybrać jedną z następujących możliwych ścieżek postępowania:-
- kliknąć w opcję „Zeskanuj kod QR” w aplikacji Google Authenticator i zeskanować kod QR widoczny w oknie „Włącz logowanie dwuetapowe” w aplikacji Comarch DMS
lub
-
- kliknąć w opcję „Wpisz klucz konfiguracyjny” w aplikacji Google Authenticator, a następnie w polu „Nazwa konta” wprowadzić nazwę, pod jaką będzie widoczne konto w aplikacji Google Authenticator, a w polu „Twój klucz bezpieczeństwa” wpisać 16-cyfrowy kod dostępny w ramach pola „Klucz bezpieczeństwa” w oknie „Włącz logowanie dwuetapowe” w Comarch DMS. Po wprowadzeniu wartości należy nacisnąć przycisk „Dodaj” w aplikacji Google Authenticator
[Zapisz].
Kiedy operator zeskanuje kod albo wprowadzi klucz bezpieczeństwa w aplikacji Google Authenticator, urządzenie mobilne zostanie połączone z serwerem DMS. Następnie Google Authenticator działa bez konieczności podłączenia do internetu na podstawie czasu – należy jedynie co pewien czas umożliwiać aplikacji połączenie z internetem, aby została dokonana synchronizacja zegara.
Po wprowadzeniu prawidłowego kodu weryfikacyjnego i naciśnięciu przycisku 
[Zapisz] okno „Włącz logowanie dwuetapowe” zostaje zamknięte, logowanie dwuetapowe zostaje włączone, a link dostępny w sekcji „Logowanie dwuetapowe” w zakładce „Konfiguracja” zmienia się na link 
[Wyłącz logowanie dwuetapowe].
Aby wyłączyć logowanie dwuetapowe dla danego operatora, należy przejść na zakładkę 
[Panel użytkownika], a później do zakładki „Konfiguracja” w aplikacji desktop Comarch DMS. Następnie należy w ramach sekcji „Logowanie dwuetapowe” kliknąć w link 
[Wyłącz logowanie dwuetapowe].
Po kliknięciu w link 
[Wyłącz logowanie dwuetapowe] zostaje otwarte okno „Wyłącz logowanie dwuetapowe”.
Następnie w polu „Wpisz kod weryfikacyjny z aplikacji Google Authenticator” dostępnym w oknie „Wyłącz logowanie dwuetapowe” w Comarch DMS wpisać 6-cyfrowy kod weryfikacyjny wyświetlany w aplikacji Google Authenticator, zanim upłynie jego ważność, oznaczona zanikającym niebieskim kołem (kod jest ważny 60 sekund) – jeśli dany kod wygasł, w Comarch DMS należy wpisać kolejny wygenerowany kod. Później operator powinien kliknąć przycisk 
[Zapisz].
Po wprowadzeniu prawidłowego kodu weryfikacyjnego i naciśnięciu przycisku 
[Zapisz] okno „Wyłącz logowanie dwuetapowe” zostaje zamknięte, logowanie dwuetapowe zostaje wyłączone, a link dostępny w sekcji „Logowanie dwuetapowe” w zakładce „Konfiguracja” zmienia się na 
[Włącz logowanie dwuetapowe].
