Jeśli w systemie widnieją nadpłaty za poprzednie okresy, można je uwzględnić przy tworzeniu nowej płatności do urzędu.

W oknie tworzenia płatności dostępna jest sekcja Rozlicz nadpłatę z poprzednich miesięcy. W celu rozliczenia nadpłaty należy zaznaczyć wybrane pozycje, co automatycznie pomniejszy końcową kwotę do wpłaty. Rozliczona w ten sposób zaliczka ujemna zmieni swój status na: Nadpłata (rozliczona).