W aplikacji dostępna jest możliwość zastosowania różnicowego naliczania płatności PPK.
Jeżeli została już utworzona płatność ze składkami PPK za dany miesiąc deklaracji, a Użytkownik naliczy w tym samym miesiącu kolejne wypłaty (na innych listach płac) ze składkami PPK, zostanie wygenerowany nowy zapis z kwotą składek PPK dla danego miesiąca deklaracji. Ta nowa płatność będzie wyliczona różnicowo. Kwota składek w kolejnych zapisach będzie stanowiła różnicę pomiędzy sumaryczną wartością składek PPK z naliczonych wypłat w danym miesiącu a kwotą składek PPK, dla których płatność została już utworzona.