Schemat Ministerstwa Finansów zawiera ograniczenie, mówiące o tym, że najwcześniejszy okres za jaki można złożyć sprawozdanie zaczyna się od 2016-01-01. Za okresy wcześniejsze należy złożyć sprawozdanie finansowe jak dotychczas, w formie papierowej.
Powyższy komunikat pojawia się po naciśnięciu przycisku Importuj w przypadku gdy podczas tworzenia e-Sprawozdania Finansowego wskazano w polu Wartości w sprawozdaniu opcję: W tysiącach złotych. Wówczas użytkownik powinien w aplikacji Comarch e-Sprawozdania dodać nowe e-Sprawozdanie Finansowe i w drugim kroku kreatora wskazać w polu Wartości w sprawozdaniu opcję: W złotych i groszach.
Powyższy komunikat pojawia się po naciśnięciu przycisku Importuj w przypadku gdy:
Powyższy komunikat pojawia się po naciśnięciu przycisku 
Zapisz i waliduj ze schemą MF w przypadku, gdy w e-Sprawozdaniu Finansowym nie uzupełniono którejś z sekcji: Wprowadzenie, Pozostałe Noty (przynajmniej jedna nota).
Po naciśnięciu opcji Szczegóły pojawia się informacja, jakie wymagane pola nie zostały uzupełnione.
Plik XML z e-Sprawozdaniem Finansowym można zapisać na dysku:
..Od wersji 2023.1 możliwy jest pełny wydruk sprawozdania finansowego wraz z informacją dodatkową. niezależnie od formatu, w którym została ona dodana. Możliwe jest równoczesne wydrukowanie not w formatach Word (docx), PDF lub plikach graficznych.
Aplikacja Comarch e-Sprawozdania od wersji 2019.2 umożliwia zaimportowanie do Rachunku zysków i strat kwot z poprzedniego roku. W zestawieniu księgowym w programie Comarch ERP Optima należy na zakładce [Kolumny] wskazać kolumnę Poprzedni okres.
Szczegóły funkcjonalności zaprezentowane zostały w bezpłatnym e-szkoleniu Przygotowanie e-Sprawozdania Finansowego na podstawie danych zawartych w programie Comarch ERP Optima.
Po zainstalowaniu aplikacji, która nie została wcześniej zintegrowana zostanie pokazany ekran domowy
sprawozdania. Użytkownik powinien wybrać opcję Ustawienia i tam wskazać czy aplikacja będzie zintegrowana z systemem ERP Optima.
Aby rozpocząć pracę należy następnie skonfigurować połączenie do bazy konkretnej firmy. Dzieje się to za pomocą przycisku Dodaj połączenie. Przekierowuje on do definiowania jego parametrów, czyli wyboru użytkownika oraz jego hasła w systemie Comarch ERP. W polu Operator należy wskazać kod operatora, który ma pracować w aplikacji Comarch e-Sprawozdania. W przypadku, gdy operator nie posiada hasła, należy nacisnąć przycisk Dodaj, bez uzupełnienia hasła. Lista zawężana jest do operatorów, na których w Optimie w Start/Konfiguracja/ Program/ Użytkowe/ Operatorzy w polu Operator używa modułów zaznaczono moduł e-Sprawozdania. Ustawienia te należy zapisać.
Po uzupełnieniu danych i ich potwierdzeniu przyciskiem Dodaj użytkownik jest przenoszony na okno startowe, skąd może zalogować się do konkretnej firmy lub przejść bezpośrednio do ostatnio przeglądanych sprawozdań.
Instalator do aplikacji Comarch e-Sprawozdania dostępny jest z poziomu Indywidualnych Stron Klientów/Partnerów, w zakładce Comarch e-Sprawozdania/ Pobierz wersję.