Funkcjonalność obsługi jednostek logistycznych jest domyślnie wyłączona po zainstalowaniu aplikacji Comarch WMS Zarządzanie. Aby umożliwić korzystanie z jednostek logistycznych – dodawania nowych typów nośników, wiązania dyspozycji magazynowych z jednostkami logistycznymi należy z poziomu menu Ustawienia/Ogólne zaznaczyć parametr ‘Obsługa jednostek logistycznych’.
Jednostka logistyczna pozwala na zgrupowanie zasobów w jeden obiekt logistyczny, a tym samym sprawne zarządzenie zasobami.
Typy jednostek logistycznych definiuje z poziomu Ustawienia/Konfiguracja jednostek logistycznych.
Konfiguracja jednostek logistycznych umożliwia:
- Dodawanie nowych typów jednostek logistycznych,
- Konfiguracja parametrów jednostek logistycznych,
- Dodanie nowych parametrów jednostek logistycznych,
- Usunięcie typu jednostki logistycznej – usunięcie typu nośnika jest możliwe tylko wtedy, gdy nie został on jeszcze użyty (nie stworzono konkretnego nośnika tego typu na dokumencie magazynowym). Wyjątek stanowi „Europaleta”, która jest dodana przy instalacji systemu (brak możliwości usunięcia pomimo faktu, iż nie została wykorzystana w systemie)
- Zmiana aktywności typu jednostki logistycznej – w przypadku, gdy dany typ jednostki logistycznej jest dezaktywowany, nie jest on widoczny na liście typów nośników dostępnej z poziomu menu Jednostki logistyczne. Skutkuje to brakiem możliwości utworzenia nośnika o dezaktywowanym typie.
W przypadku wyboru 
zostaniemy przekierowani do dokumentacji dotyczącej konfiguracji jednostek logistycznych. Ikona 
skutkować będzie przeniesieniem do ustawień ogólnych nośników: 
Z tego miejsca możliwy jest wybór sposobu wyliczania limitu miejsc paletowych (szczegóły dotyczące tej funkcjonalności znajdują się w dokumentacji pod adresem: Wyznaczanie położenia według dostępnych miejsc paletowych) jak również zaznaczenie parametru warunkującego wydawanie tylko jednorodnych jednostek logistycznych. Włączenie tej opcji umożliwi blokowanie wydań z nośnika, na którym znajdują się różne artykuły lub różne partie artykułu. Blokada ta ma zapobiec pomyłkom przy wydawaniu towaru przez magazynierów. Przy włączonej blokadzie, aby wydać towar
z nośnika, na którym znajdują się różne partie towarów, magazynier będzie najpierw musiał uporządkować zasoby – dokonać przesunięcia innych partii, aby na nośniku pozostała tylko jedna partia towaru,
Natomiast ikona 
spowoduje otworzenia okna konfiguracyjnego nowego typu jednostki logistycznej:
- Zakładka ogólne:
- Nazwa – unikalna nazwa typu jednostki logistycznej
- Typ kodu EAN:
- EAN – 13 – wartość domyślna
- EAN – 8
- EAN – 13 Wagowy
- SSCC
- Inny – dla typu inny
- Jednostka miary systemu ERP – możliwość wyboru jednostki miary zdefiniowanej w systemie ERP (podczas wyliczania dostępności wolnego miejsca dla nowej jednostki logistycznej, sprawdzana jest składowana liczba zasobów, według przelicznika jednostek pomocniczych, które powiązane są z danym typem jednostki logistycznej). Opis w artykule: Wyznaczanie położenia według dostępnych miejsc paletowych
- Rodzaj:
- Jednorodna – na jednostkach tego typu można składować tylko towary w obrębie jednej partii,
- Niejednorodna – na jednostkach logistycznych tego typu można składować towary z różnych partii,
- Domyślna – określa czy typ jednostki logistycznej będzie podpowiadany w pierwszej kolejności podczas realizacji dyspozycji w Comarch WMS Magazynier,
- Dodatkowy unikalny numer nośnika – określa czy jednostka może być oznaczana dodatkowymi unikalnymi numerami fizycznych jednostek logistycznych. Szczegóły dotyczące tej funkcjonalności znajdują się w dokumentacji pod adresem: Dodatkowy unikalny numer nośnika
- Zakładka wymiary:
- Długość [m],
- Szerokość [m],
- Wysokość [m],
- Waga [kg],
- Zakładka model obsługi jednostek logistycznych:
- Powiąż z kartą towarową w celu ewidencji przepływu jednostek logistycznych – umożliwia powiązanie danego typu jednostki logistycznej z kartą towarową. Opis w artykule: Obsługa opakowań kaucjonowanych i jednorazowych
- Zakładka limity:
- Maksymalna wysokość [m]: możliwość edycji na liczbę dodatnią (z precyzją 4), określa maksymalną wysokość jednostki logistycznej, jaka może ustawiona podczas realizacji dyspozycji magazynowej na kroku: Wysokość jednostki logistycznej (opis w artykule: Algorytmy zarządzania magazynem)
- Maksymalny ciężar [kg]: możliwość edycji na liczbę dodatnią (z precyzją 4), określa maksymalną wagę zasobów, jaka może zostać umieszczona na danej jednostce logistycznej.
- Zakładka zakres kodu EAN:
- Minimum – dolny zakres kodu EAN,
- Maksimum – górny zakres kodu EAN,
- Domyślna liczba generowanych kodów- określa liczbę kodów, jaka zostanie podpowiedziana podczas wydruku etykiet logistycznych w Comarch WMS Magazynier->Menu na skróty->Wydruk etykiet jednostek logistycznych.
W przypadku wyboru typu kodu jednostki: SSCC wyświetli się dodatkowa sekcja obejmująca konfigurację struktury kodu SSCC:
- Cyfra uzupełniająca – jest stosowana do zwiększenia pojemności numeru SSCC. Nadawana jest przez firmę, która przydziela kod SSCC jednostce logistycznej, często jest to numer nadawany w zależności od oddziału, czy miasta lokalizacji magazynu.
- Prefix firmy GS1 – ) jest nadawany przez organizację krajową GS1 firmie, która tworzy daną jednostkę logistyczną (jest to ten sam prefiks, które firma otrzymała w celu np. znakowania jednostek handlowych). Zapewnia on unikalność numeru na całym świecie, ale nie identyfikuje on pochodzenia jednostki.
- Seryjne oznaczenie jednostki logistycznej – jest numerem seryjnym wybranym przez firmę, której przydzielono prefiks firmy, do wypełnienia pozostałych cyfr numeru do N17. Jest to unikalny numer identyfikujący jednostkę w danej firmie.
- Liczba znaków,
- Rozpocznij znakami – umożliwia wydzielenie fragmentu kodu na dodatkowe oznaczenie, z możliwością przypisywania wartości w zależności od zdefiniowanego warunku SQL: na przykład magazynu, czy realizowanego procesu.
- Domyślna liczba generowanych kodów – określa liczbę kodów, jaka zostanie podpowiedziana podczas wydruku etykiet logistycznych w Comarch WMS Magazynier->Menu na skróty->Wydruk etykiet jednostek logistycznych.
Po uzupełnieniu danych, w celu zapisania zmian, należy wybrać opcję [Zapisz], dostępnej w prawym górnym rogu formatki 
.
W aplikacji udostępniono również możliwość dodawania parametrów jednostek logistycznych, jako dodatkowa informacja o danym nośniku.
W aplikacji brak jest predefiniowanych parametrów dot. nośników. Wymagane jest zatem ich dodanie w ramach Konfiguracji słowników uniwersalnych, która znajduje się w zakładce Ustawienia:
Operator będzie miał dostęp do słowników uniwersalnych w przypadku, gdy zostaną mu nadane odpowiednie uprawnienia (Ustawienia->Uprawnienia operatorów).
Po wejściu w konfigurację słowników uniwersalnych należy wybrać ikonę klucza w ramach kafla Parametry jednostek logistycznych:
Dodanie parametru następuje po naciśnięciu przycisku 
, dostępnego w prawym, górnym rogu
- Nazwę – pole wymagane oznaczone czerwoną gwiazdką – *, jest to pole unikalne w obrębie wszystkich parametrów zdefiniowanych na wszystkich nośnikach,
- Typ – możliwe do wyboru opcje:
- Liczba – wartość domyślna,
- Tekst,
- Lista,
- Data,
- Wartość domyślna – możliwa do zdefiniowania, w zależności od zdefiniowanego wcześniej typu,
- Wymagalność: Niewymagany – możliwość zmiany na Wymagany. Po zmianie na Wymagany pojawi się opcja wyboru:
- Zawsze – wypełnienie danego parametru na danej jednostce logistycznej konieczne będzie zarówno w aplikacji Comarch WMS Zarządzanie, jak i Comarch WMS Magazynier,
- Magazynier – wypełnienie danego parametru na danej jednostce logistycznej konieczne będzie tylko w aplikacji Comarch WMS Magazynier,
- Aktywność – określa czy dany parametr będzie widoczny do uzupełniania w Comarch WMS Magazynier.
W celu usunięcia danego parametru należy nacisnąć ikonę kosza na śmieci – 
.
.
Następnie parametry jednostek logistycznych należy wybrać w ramach edycji danego typu jednostki. Po naciśnięciu przycisku edycji parametru:
Pojawią się już dodane parametry, gdzie po naciśnięciu ikony 
wyświetlone zostanie okno wyboru:
Po wybraniu parametru pojawi się okno:
Aby potwierdzić dodanie parametru, należy zapisać zmiany, wówczas parametr zostanie dodany dla danego typu jednostki logistycznej:
