Funkcjonalność profili umożliwia instalację kilku wersji produktów na jednej maszynie. Profil to zestaw konfiguracji, pozwalający na stworzenie niezależnego środowiska pracy.

W Comarch ERP Auto Update funkcjonują dwa rodzaje profili:

• Profil główny – tworzony podczas instalacji aplikacji Comarch ERP Auto Update.
• Profile dodatkowe – profile tworzone przez użytkowników. Każdy profil posiada niezależną konfigurację, bazę lokalną programu, katalog instalacyjny oraz katalog pobierania dodatków i poprawek, a także osobne porty pozwalające na instalację usług.