W pierwszej kolejności należy w menu Rejestry VAT na zakładce Do deklaracji VAT-UE sprawdzić, jakie transakcje zostały zakwalifikowane do deklaracji VAT-UE za wybrany miesiąc lub kwartał.
Jeśli nie zostały ujęte wszystkie transakcje należy sprawdzić czy na fakturach, które nie zostały uwzględnione został zaznaczony parametr: Rozliczać w VAT-UE
Jeśli widnieją wszystkie faktury, a mimo to nie zostały wykazane na deklaracji, wówczas należy sprawdzić, czy faktury zakupu, które nie znalazły się na deklaracji, nie mają zaznaczonego Rodzaju jako Usługi. Nabycie usług od kontrahentów z UE nie jest wykazywane na deklaracji VAT-UE.
Uwaga
Na deklaracji VAT-UE wykazywane są jedynie wewnątrzwspólnotowe dostawy oraz nabycia towarów, a także wewnątrzwspólnotowe świadczenia usług (wyłącznie sprzedaż usług, bez ich nabycia).